A professzor legkisebb gyermekének, Fanninak a születésével kapcsolatban merült fel több kérdés, miután a spermadonor adatait tartalmazó lapon nem Czeize Endre neve és adatai szerepelnek. Életrajzi könyvében azt írta, hogy nem szeretett volna újabb gyereket 43 évvel fiatalabb párjától a 2006-ban született András után. Az akkor a hetvenes éveiben járó férfinak három gyereke született első házasságából, egy pedig utolsó, házasságon kívüli kapcsolatából - közli a nol.hu.
A fiatal nő azonban testvért akart a kisfiúnak. Kompromisszumként a genetikus lefagyasztatta a spermáját azzal, hogy a nő az ő halála után, ha még akkor is úgy gondolja, felhasználhatja. A leukémiában szenvedő férfi azonban a vártnál hamarabb nézett ismét apai örömök elé. Az ekkor született gyerek, Fanni fogantatásával, a mesterséges megtermékenyítéssel kapcsolatban különös dolog derült ki: annak idején a spermadonor beleegyezői nyilatkozatára nem a professzor, hanem egy másik férfi adatai és neve, továbbá aláírása került.
Czeizel Endre párja, Dóra a férfi hagyatéki tárgyalásán jelezte, hogy két gyermeke nevében tart igényt a Czeizel-vagyon egy részére. A bekért dokumentumokon szereplő adatok azonban a kisebbik gyerek esetében nem stimmeltek. Vizsgálják azt is, hogy a lombikprogramot működtető klinika vezetése tudott-e az okirat-hamisításról.